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农业防治：选用抗病品种，如叶上禾、着粒稀、叶片挺直、株型松紧适中的水稻品种；合理施肥，避免偏施氮肥，增施磷钾肥；科学管水，分蘖期浅水勤灌、够苗晒田，孕穗期保持田间湿润；种子处理，播种前用1%石灰水或咪鲜胺浸种消毒。
化学防治：晚稻破口期是稻曲病施药预防的关键时期，应在水稻破口前7天和破口期分别施药防治。推荐药剂包括30%苯甲·丙环唑乳油（爱苗、世爱）亩用20毫升、75%肟菌·戊唑醇悬浮剂亩用10克、20%井冈霉素可湿性粉剂亩用40克等。
种子处理：播种前使用药剂如松脂酸铜、三唑酮、多菌灵等进行浸种或拌种，同时配合使用氨基寡糖素、几丁聚糖等植物免疫诱抗剂，以提升幼苗的抗病能力
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1. 管好施肥：控氮、增磷钾、不贪青
切忌偏施、迟施氮肥，中后期少追尿素；
分蘖期够肥就行，孕穗后不再猛补氮肥；
增施钾肥、硅肥，壮秆健穗，提高抗病能力。
2. 科学水管：浅水勤灌、后期干湿交替
孕穗到抽穗期不长期灌深水；
灌浆期干干湿湿、露田透气，降低田间湿度；
避免田间郁闭、高湿闷穗，减少病菌侵染条件。
3. 抓住最佳打药时间（最关键）
稻曲病防病就两个黄金期，错过就防不住：
破口前 7～10 天（孕穗末期、穗子刚要露苞）
齐穗期（大部分穗抽出）
晚稻一定要两遍药，阴雨天气必须补喷。
4. 常用特效药剂（任选一种）
苯醚甲环唑
戊唑醇
腈菌唑
肟菌・戊唑醇、嘧菌酯・戊唑醇
喷药要点：
打匀打透，重点喷稻穗上部；
避开中午高温，选傍晚或阴天喷施；
抽穗期遇连续下雨，雨停立即补喷。
5. 种子与田间管理
播种前晒种 + 药剂浸种，减少种子带菌；
合理密植，不栽过密，保持田间通风透光；
发病田块病粒不要还田，带出田外深埋，避免来年菌源加重。
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