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大棚黄瓜疫病的综合防治方法包括农业措施、嫁接防病、苗床及土壤消毒、药剂浸种、加强田间管理以及药剂防治等。
农业措施：选用黑籽南瓜作砧木，进行嫁接育苗；采用高畦栽培，覆盖地膜，减少病菌对植株的侵染机会；避免大水漫灌，避免土壤和空气湿度过高；发现中心病株后及时拔除并深埋嫁接防病：用黑籽南瓜或白籽南瓜做砧木进行嫁接可防疫病及枯萎病等。
苗床及土壤消毒：苗床每平方米用25%甲霜灵可湿性粉剂8克与土拌匀撒在苗床上；定植前用25%可湿性粉剂750倍液喷施地面。
药剂浸种：可用72.2%霜霉威水剂或25%甲霜灵可湿性粉剂750倍液浸种30分钟后催芽。
加强田间管理：采用配方施肥技术，苗期控制浇水，结瓜后做到见湿见干；一旦发现疫病，及时将病株拔除深埋，尽量控制浇水，以抑制病情发展。
药剂防治：发病前或发病初期喷洒或浇灌下列药剂：72.2%霜霉威水剂600~700倍液，或64%霜·锰锌可湿性粉剂500倍液，每隔7~10天1次。
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大棚黄瓜疫病的综合防治需结合农业、化学及生态措施，核心是“预防为主，综合防治”。
1.农业防治：选用抗病品种，与非瓜类作物实行4年以上轮作；采用云南黑籽南瓜作砧木进行嫁接防病；播种前对种子消毒（如55℃温水浸种15分钟）；加强田间管理，推广高畦栽培，及时开沟排水，降低田间湿度。
2.生态调控：设施栽培中，白天控温32-35℃，夜晚降温至10-16℃，加大通风，降低棚内湿度，创造不利于疫病发生的环境。
3.化学防治：发病初期可选用72.2%普力克水剂600～700倍液、50%甲霜铜可湿性粉剂600倍液或69%烯酰·锰锌可湿性粉剂600倍液喷雾，每隔7-10天喷一次，连续2-3次。雨前喷药效果更佳。
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